基础医学院医学生物学实验中心组建于 2005年6 月，它属于综合性的实验教学中心及科研平台性质的实验室。承担着基础医学院多个学科的本科生、硕士、博士研究生的实验教学及科研任务。

中心不仅拥有BDFACSAriII流式细胞分选仪和C6流式细胞分析仪、安捷伦Novocyte3080流式细胞分析仪、赛默飞Evosm7000全自动细胞成像仪、蔡司Imager Z2研究级正置荧光显微镜、BioTek H1全功能酶标仪、Bio-Rad CFX96实时荧光定量PCR仪、ABI Q3实时荧光定量PCR仪、安捷伦MX3000p实时荧光定量PCR仪、PHD高压均质机、ECM830方波电穿孔、赛默飞Neon电穿孔及贝克曼LE-80K超速离心机等多台国内外领先高端仪器，还配有奥林巴斯正置荧光显微镜和倒置荧光显微镜、Nanodrop超微量紫外分光光度计、新芝超声破碎仪、细胞计数仪、日立高速冷冻离心机、海尔台式冷冻离心机、天能化学发光仪和凝胶成像仪、比朗雪花制冰机等常用仪器，使中心仪器形成高低搭配，成为了多层次的实验公共科研服务平台，可从事生物化学、分子生物学、免疫学、遗传学、微生物学等多学科的研究工作。为学院的科研、教学、人才培养及学科建设方面提供了有力支撑。

中心是学院开展科研活动的主要场所，仪器使用总机时平均每年超过7000小时，同时中心平均每年为学院约200名研究生提供培训服务，包括实验室和仪器安全知识，仪器使用相关规定、仪器原理和应用以及上机操作。不仅为学生开展科研工作提供了坚实有力的技术保障，而且成为学院的学科建设的良好载体，提升学科发展水平。

2017年，中心加入了吉林大学测试科学实验中心，成为基础医学分平台，在为学院服务的同时也面向校内外开展测试服务。中心通过开放共享，建立有效的运行机制，释放开放服务活力，实现不同科研机构和团队之间科技信息、学术思想、科研活动和科技人员的互动。不仅有利于整合各类资源，产生更多更优秀的成果，更好地服务区域经济社会发展，也有利于学院科技创新能力的进一步提高，从而促进学科的交叉、融合和发展。